在早稻育秧时节，往往遇上低温寒潮或阴雨连绵的天气，如此时早稻秧田的水层管理不当，可造成秧苗的根部吸收能力减退，苗体上下水分失调，病菌也乘苗体虚弱之时侵入，从而导致早稻烂秧。早稻烂秧的防治措施如下：
早稻育秧
透水通气。秧田既要透水，以利早稻种子发芽出苗，又要通气，便于早稻秧苗扎根生长。具体做法：先将稻田中的土整细，起沟做畦，施足底肥，把畦面泥块打碎，初步耙平；然后放水浸泡，再进一步把稻田中的畦面整平。
计划育秧。掌握早稻适宜播期和确定秧苗适宜秧龄，以避免烂秧。早稻正常出苗的温度为15℃，因此露地育早稻秧时，要等到气温稳定上升到12℃时开始播种。若育秧早，气温较低，稻苗生长慢，秧龄宜适当长些；若育秧晚，气温较高，稻苗生长快，秧龄则宜短些。
稀播匀播。秧田播种量应根据秧龄长短及育秧时节气温高低而定。原则上要求秧苗稀播匀播，这样才能使每株早稻秧苗都能得到足够的阳光、空气和养料，茁壮生长。如播种过密，则会减少秧苗后期的受光量，影响同化作用，发根力降低，苗体不壮，易烂秧。一般情况下，春稻田秧龄20天内的小苗，每亩下种180~200公斤；秧龄30天左右的大秧苗，每亩下种80~100公斤。
培育壮秧。培育壮秧是早稻高产和防止烂秧的基础。培育适龄壮秧可采用湿润育秧办法。在立苗期，一般只在育秧秧田的沟中灌水，保持育秧田田面的湿润通气，而不灌水上田面，促使早稻种子迅速生根立苗。在扎根期，要灵活掌握水层，防冻防晒。保持育秧田既有水又通气，以利扎根保苗。
