乌骨鸡细菌性疾病可用抗菌药物防治，而病毒病只有依靠免疫接种来预防。所以，制定合理的免疫程序格外重要，只有具备科学、合理的免疫程序，才能保证鸡群的健康，从而实现最大的经济效益。
免疫程序的制定，一要根据本地区疫病流行的状况和饲养环境，即对本地区从未发生过的传染病不作预防，对本地区以前未发生过，刚开始发生且危害严重的必须预防，对常发生的危害重的重点预防，如禽流感、鸡新城疫、肾传支等。二要根据鸡群的状态，即只有健康的鸡群，才能对疫苗产生免疫应答，产生抗体。在鸡群应激或疾病状态下免疫的效果较差，特别是鸡群患有某些免疫抑制性疾病如白血病、传染性法氏囊病、马立克氏病，免疫系统受损等，接种后只能产生低水平抗体，且不良反应多。三要依据疫苗自身的特点，如毒力的强弱、保护期的长短等。一般是灭活苗和弱度毒苗配合使用。
常用乌骨鸡的免疫程序和保健程序如下：
1日龄：孵化出壳24小时内，马立克疫苗1羽份皮下注射。也可以同时注射庆大霉素防治白痢。
1－3日龄：主要通过用药降低支原体在雏鸡体内的数量，对预防慢呼的发生是非常有意义的，同时使用防治大肠杆菌的药物也很有必要，所以要选则向甲磺酸培氟杀星等，对慢呼和大杆都有较好的控制作用。1-3日龄最好在投给免疫增强剂，如黄芪多糖，能起到对损伤的免疫器官给予恢复作用，提高雏鸡机体内的特异性免疫机能。
4日龄：肾传弱毒苗+新城疫Ⅳ系，2倍量饮水或点眼。同时注射肾传油乳剂单苗0.25毫升。同时在饮水中添加电解多维，补充营养，防治应激。
10日龄：肾传弱毒苗+新城疫Ⅳ系，2倍量饮水或点眼。同时断喙，1头份鸡痘翼膜刺种。饮水中添加电解多维，补充营养，添加VK3防治出血。
15日龄：法氏囊中等毒力苗1倍量滴口或1.5倍量饮水，再用新城疫、禽流感H5混合后，每羽皮下注射0.3毫升。
22日龄：新城疫I系苗每羽皮下注射2头份（新城疫高发区）或者新城疫Ⅳ系苗2倍量饮水。新城疫、禽流感H5混合后，每羽皮下注射0.3毫升。该日龄时最易感病毒性疾病，大多发，法氏囊，新城疫肾传支，和流感，所以要投给中药抗病毒药物，同时加入广谱抗菌药防治呼吸道感染大肠杆菌病。饮水中添加电解多维，补充营养。
40―45日龄：新城疫、传支二价二联油乳苗每羽皮下注射0.5毫升。为防治本阶段的肠炎和呼吸道病，可以在饲料中添加0.5%的大蒜素和北里霉素预防。
65日龄中鸡，用鸡新城疫IV系疫苗饮水免疫。中后期为提高生长，可以添加促使生长和提高免疫力的大黄苏打散和黄芪、党参、茯苓、甘草等，按1%添加到饲料中。
