病害
白锈病：由真菌中的一种鞭毛菌引起。叶、茎、花均可发病，叶背面较多。通常氮肥过多，植株柔嫩，雨水多，湿度大，时冷时暖，发病较重。连作病源多，发病更为严重。
防治方法：（1）及时间苗，清沟排水，中耕除草，降低田间湿度，促使幼苗生长健壮，增强抗病力。（2）苗期要结合间苗，剔除病苗，后期要注意摘除病叶，以免病菌传播。⑶发病初期，喷洒波尔多液，抑制病害蔓延。⑷收获时将病残枝搜集烧毁，以消灭越冬病源。
黑斑病： (1)症状。在叶上产生圆形或近圆形病斑，褐色至黑褐色，病斑常具轮纹， 周围有退绿晕圈，病斑较大，一般直径3—l0mm病斑正面有黑褐色霉状物，即病原菌分生孢子。后期病叶枯萎脱落。 (2)发病规律。病原菌以分生孢子在病部越冬，为翌年的初次侵染源。自5月起开始发生，一直可延续到10月。其中以6—9月发生最为严重。高温多雨季节有利于发病。
防治措施：①合理轮作，清洁田园，消灭越冬菌源。②加强田间管理， 增施磷、钾肥，提高抗病力。③发病初期，喷洒1:1:100的波尔多液或65%代森锌600~800倍液，每隔10~15d喷雾1次，每亩用量75kg，连续喷2—3次。
灰斑病： (1)症状。受害叶面产生细小圆形病斑，略凹陷。病斑边缘褐色，中心部灰白色。病斑变薄发脆，易龟裂或穿孔。病斑直径2-mm，叶面生有褐色霉状物，即病原菌子实体。自老叶先发病，由下而上蔓延。后期，病斑可互相愈合，病叶叶枯黄而死。(2)发病规律。病原菌随病残组织越冬，成为翌年的初次侵染源。种子亦可带菌06月上旬开始发病，月下旬至9月上旬为盛期。6日平均温度在23℃～25℃时，有利于发病，蔓延迅速。
防治措施。①轮作和清洁田园，减少菌源。②雨季开沟排水，降低田间 湿度。③发病初期，喷洒1:1:100的波尔多液保护，或用 65%代森锌 600—800倍液喷雾防治。
菌核病：为板蓝根的主要病害之一。发病严重时，植株大批死亡。(1)症状。危害根、茎、叶和荚，以茎部受害最重。发病初期，基部叶片首先发病。病斑初呈水渍状，后为青褐色，最后叶片腐烂，仅剩叶脉。在多雨高湿时，受害茎秆内布满白色菌丝，皮层软腐，茎秆碎裂成乱麻状。茎中空，生有黑色鼠粪状菌核。在茎秆表面或叶上可见菌核。茎叶受害后，枝叶萎蔫，逐渐枯死。(2)发病规律。病原菌以菌核遗落在土壤中或混杂在种子间越冬，成为翌年的初次侵染源。生长期间生子囊孢子借风雨飞散，进行再次侵染，扩大危害。在4月中旬发病，4月下旬到5月份为发病盛期。偏施氮肥、排水不良、管理粗放、雨后积水等，均有利于发病。
防治措施：①水旱轮作，避免与十字花科作物轮作。②加强田间管理，雨后及时疏沟排水，少施氮肥，增施磷、钾肥，提高植株抗病力。③发病初期喷洒65%代森锌400—600倍液，每亩用量75—lOOkg，隔7d喷1次，连喷2—3次。
霜霉病：由真菌中的一种鞭毛菌引起。主要危害叶部。一般于6月上旬开始发病，7月中旬发病严重。土壤中的病残组织是霜霉病的初次侵染区。板蓝根生长期间，病叶背面的分生孢子借风雨传播，反复侵染。
防治方法：⑴选留种子：选择无病地块作留种田，留种植株分别采获，种根分别存放。⑵清洁田园：采挖板蓝根时，清除地上枯枝残叶，减轻病源。⑶注意排水：土壤湿度大是板蓝根霜霉病发生的有利条件，雨后要及时排水，降低田间湿度。⑷合理轮作：应与禾本科作物玉米等进行轮作。⑸喷药防治：发病初期用50％甲基托布津800-1000倍液，或5％多菌灵1000倍液喷洒。
白粉病：由真菌中的一种子囊菌引起。主要危害叶片。一般低温多湿，施氮肥过多，植株过密，通风透光不良，均易发病。高温干燥时，病害停止蔓延。
防治方法：⑴排除田间积水，抑制病害发生。⑵合理密植，氮、磷、钾肥合理配合，使植株生长健壮，增强抗病力。⑶发病初期摘除病叶，收获后清除病残株、落叶，集中烧毁。⑷药剂防治：喷洒65％福美锌可湿性粉剂300-500倍。
虫害
小造桥虫：8-9月危害。1-3龄幼虫咬食叶肉，残留表皮，形成透明小点，5-6龄咬食全叶。老熟幼虫在叶边缘或茎叶间吐丝作薄茧化蛹。冬季以蛹在田间杂草中越冬，来年孵化危害。
防治方法：用90％敌百虫1500倍液喷洒，喷药时应着重喷中、下部老叶，效果明显。
蚜虫：发生时多密集在嫩叶、新梢上吸取汁液，使叶片、嫩梢卷缩、枯萎，生长不良。
防治方法：⑴板蓝根收获后，清除残枝落叶及地边杂草，集中烧毁，消灭越冬虫口。⑵药剂防治：用4％乐果1500倍液喷洒。或以土农药喷杀。土农药制法：烟筋0.5公斤，石灰0.5公斤，水25公斤配成烟筋石灰水药液。
菜粉蝶： 粉蝶科，菜粉蝶，Pieris repe L.幼虫危害叶片，2龄前仅仅取食叶肉，3龄后取食叶片形成孔洞缺刻，可见绿色粒状粪便。
