在草菇生产中，常可见成片小草菇萎蔫死亡。究其原因，主要有几种：
草菇采收
1．通风不良：草菇高温好氧，菇农为提高棚温，延长覆盖时间，致使棚内二氧化碳过多，草菇缺氧而死。但通风量太大，水分易散失，也不利于草菇生长。为解决此矛盾，在播种后4天内，每天上午约10点，通风半小时，随菌丝量增多及大量“针头菇”出现，通风时间逐渐延长至每天2小时。
2．气温骤变：草菇是恒温结实型菌菇。菌丝生长适温为30℃--39℃，低于15℃或高于42℃，停止生长。子实体生长温度为28℃--33℃，20℃以下或45℃以上都会使菇蕾萎蔫死亡。因此气温低时，采取双层覆膜等措施保温；盛夏酷暑，喷水并搭棚遮阴降温，尽量减小菇房温差。
3．湿度不宜：水分影响草菇生长。水分不足，菌丝体生长缓慢，子实体干枯死亡；水分过多，菇床通风不良，造成大量烂菇、死菇。因此要掌握适宜湿度，培养料最适含水量为70％；菌丝体生长期，空气相对湿度为80％；子实体生长阶段，空气相对湿度为90％。
4．水温不适：草菇生长不仅需大量水，且对水温也有严格要求，如喷洒低于23℃或高于40℃的水，第2天幼菇会萎蔫。因此喷水在早晚进行，水温以约30℃为好。
5．环境偏酸：草菇喜偏碱性环境，当培养料偏酸时(pH值6.5以下)，就难以成长且易受杂菌侵染。故配料时所加的石灰量要达到5％，每采完—潮菇后要喷1％石灰水或4％草木灰水，提高pH值。
6．采摘粗心：采摘时，不要碰摸正生长幼菇，如草菇密集丛生，要等大部分草菇成熟时，一起采下。正确采摘法：一手按住草菇生长部，另一手将成熟草菇扭转提起，减少对幼菇损伤。
7．病虫蔓延：栽培管理不当，会导致病虫害爆发。培养料含氮过高时，鬼伞大量出现，和草菇争夺养分，造成草菇死亡，所以配料时，要控制含氮量。用玉米芯、麦秸、稻草作主料时，应加5％麸皮或4％发酵腐熟畜禽粪。用富含氮的棉子壳作主料时，可不加氮源，但注意控制螨虫危害。螨虫发生后，培养料内菌丝很快被吃光，床面幼菇大量死亡。在拌料时，喷洒敌敌畏或敌百虫800倍液，防治效果好。当料面出现霉菌时，在污染区撒生石灰粉，同时加强通风降湿，抑制杂菌蔓延，保证草菇生长。
