在食用菌栽培中，常有菌丝萌发后不吃料、发黄而萎缩，严重影响着食用菌效益。现将食用菌菌丝萎缩的发生原因及防治方法介绍如下：
食用菌菌丝萎缩
一、高温烧菌：播种期气温高、培养料过厚、发酵后料温未稳定下降等，使培养料内温度高于30℃。防治方法：食用菌播种期要避开高温期，播种时，料温应稳定在25℃以下。播种后，如菌丝因高温而萎缩，应重新翻堆通风，再调节好培养料湿度，重新播种。
二、料内有氨气：建堆时，氮肥添加量过多，或氮肥加的过晚(后期翻堆时才加)，菌种播种后，培养料内存在氨气。防治方法：培养料加尿素等化肥时，要在建堆时适量加入。发现料内有氨气，及时打开门窗，并喷2%甲醛溶液进行翻料，待无氨味后，再重新播种。
三、培养料过干：播种时，培养料偏干，若气候又干，菌丝萌发后，吃料生长缓慢，细弱无力而萎缩。防治方法：可在料面覆盖一层湿稻草(用0.5%石灰水浸湿)，使菌丝重新萌发吃料。播种如遇干燥天气，播后3天，关闭门窗。用层播加封面播种法更好。
四、培养料水分过多：培养料含水过多，覆土后又遇高温，或高温时，喷重水，又没及时通风，使菌丝因供氧不足、活力下降而萎缩。防治方法：堆料时，注意控制水分，若翻堆时，发现料含水过高，应摊开，略加晾晒，再行堆制，发酵好的料含水量以60%～65%为宜。后期喷重水引起的菌丝萎缩，进行通风后，菌丝可恢复生长。床面覆土层总厚度不低于4～4.5厘米。
五、菌种质量差：购种途中菌种受热，降低菌丝活力；菌种没能及时使用，菌种老化，生长势变弱。播种后，再遇不良环境，会导致菌丝萎缩。防治方法：选适宜培养料培育菌种，菌种应菌丝粗壮、萌发力强；购种时，避开高温天气；不用老化菌种。
六、虫害：主要是螨类害虫，前期出现，肉眼不易看到，主要为害食用菌菌丝，使菌丝断裂而萎缩。在堆肥、覆土中都能带入害虫，会造成严重为害。防治方法：对螨类害虫，要综合防治。做好培养料的后发酵，覆土进行杀虫处理。另外，在播种前向料内撒保菇粉能起防治作用。在栽培中，发现害虫，及早用药剂防治。
