肥料是棉花高产的物质基础，按需施肥是棉花施肥的最高原则。有条件的应进行测土施肥，根据土壤速效养分含量和棉花高产需要，确定施什么肥料和施肥量。就北方多数棉田而言，应增加钾肥用量，减少磷肥用量，氮肥则主要用于追肥，或者施用“高钾、低磷、中氮”的配方肥。如果用氮磷钾等量复合肥，每亩用量不宜超过25公斤，再增加12.5公斤钾肥做底肥，另备15公斤尿素或其他氮肥做追肥。
施用底肥一定要翻入土中，越深越好，尽量使之减少损失，充分发挥肥效。当前大部分棉田都未耕耙整地，施好底肥有以下方法：
1、可将底肥用的化肥在耕地前撒在地表，和农家肥一齐翻入地中。这样施得深、施得匀，养分损失少，可被分布在各处的棉根吸收利用。
2、在播种机上安装施肥器，和播种同时进行，前边播肥，施在两行棉花中间，深施8至10厘米，后边播种。这样作业省工，肥料集中，养分损失少，幼苗利用快。
3、播前设计好行距和行数，插上标记，先将一行肥料施在预留的两行棉花中间，深施10厘米以上，然后再进行播种，这样肥料施得深。
4、如果不耕翻而采用旋耕，也可在旋耕前将肥料撒在地表，但要尽量旋耕深达15厘米左右，最忌施肥后浅旋，使大部肥料留在土壤上层，养分损失大。
无论耕地前或旋地前施肥，都可进行耕旋后浇水造墒。按亩灌水量60至80方计算，水深为9至12厘米，肥料不会随水渗入地下，而保存在地表浅土层内，可供棉花根系吸收利用。
施底肥是很关键的棉花高产措施，关系到棉花产量和植棉效益，一定要施好。
