1软腐病
1.1病害症状培养料表面或菇体上长满一层白色绵毛状菌线、纤细绵软但生长速度很快、逐渐染病的菇体从菌基部开始向上蔓延淡褐色病态，菇体逐渐软腐；染病后约一周时间菇体自动倒伏，或轻轻一触即倒，如同大白菜得了软腐病，但软腐菇体无臭味；尚未软腐的菇体生长速度极慢，菌盖逐渐呈土黄色，无生机不鲜亮，与正常菇体区别明显；染病料不再出菇即使勉强现蕾也很快软腐，无商品价值。
1.2发病原因软腐病病菌一般生存于地表耕作层（20cm）内，尤其是有机质含量较高，土壤肥沃的地块，病菌基数很高，如菜园土、苗床土以及村庄周围100m左右土地耕作层等。一般平菇生产用地大多在村头巷尾，房前屋后，而栽培用土也是就地取材，就很容易使病菌污染栽培料，当栽培棚内温度在15～30℃，相对空气温度90%左右时，病菌孢子迅速萌发，其菌丝首先侵染培养基料，此后随着数量的扩大，危害程度逐渐加深，或使培养料不再出菇，或使已发生的菇体逐渐软腐。
1.3预防措施①栽培大棚远离发病区建造，这是根本的预防手段。②继续在发病区进行生产时，应对栽培大棚作如下处理：a.焚烧：将原大棚上部架杆、覆盖物全部除去将墙体刮除1～3cm，地面翻松约10cm后，在棚内铺厚约20cm废弃作物秸秆或柴草类，四周墙根部尽量堆高堆多一些，点燃焚烧。焚烧后的灰烬翻入土内并整平地面，重新覆膜并尽量密闭，经约10d即可启用。b.药物杀菌：将大棚墙体刮除1cm，地面翻松5cm后，配制6%甲醛水溶液，根据发病程度掌握使用量在200～600g/平方米，实行毯式喷洒杀菌。注意要点：一要喷洒均匀、不留任何死角，无药区；二要喷洒速度快，最好用高压喷雾器2～3人操作；三是喷完后立即密封大棚出入口以及通风口，一周后即可启用。也可根据发病程度，用多菌灵0.3～0.6kg，甲醛0.2～0.4kg共同溶于100kg水中，按上述方法处理大棚并均匀喷洒，亦有很好的效果。③栽培料中加入干料重0.3%的多菌灵或使用活性发酵剂进行高温堆酵（65～70℃）处理。④栽培用土的处理：远离栽培区是老栽培区、原发菌区取土，过筛使土壤颗粒直径3mm以下，将过筛后的细土暴晒，最好能使其充分干燥，每吨土用50%多菌灵250g、36%甲醛400g兑水500kg边喷边拌，拌两遍并喷完药液，然后覆盖塑料膜，约一周后可随用随取。⑤菌袋入棚一段时间，尤其是出菇后，如果培养料表面出现白色绵毛（绒毛）状菌丝后，应立即用刀铲类工具将发病区刮除约2cm基料，并在该区域涂抹400倍多菌灵溶液，将刮除物清除干净并随之焚烧处理，不可使用土埋方式，更不能随便扔弃。⑥一旦发生染病菇，应立即加强通风并停止喷水，使棚内空气湿度降至最低，并立即将病菇摘除，参考上述措施清理病区和处理病菇，并对使用工具在400倍多菌灵溶液中浸泡杀菌。1～2周后观察若无霉菌菌丝长出，可重新正常管理。⑦发病初期或潮间无菇生长时，可对培养料表面进行一遍全面刮除处理，方法同上。⑧发病较重或发现较晚，已形成严重危害的栽培大棚则不必进行上述处理，只有清除基料，重新进行大棚杀菌处理后再行栽培生产。
2腐烂病
2.1病害症状发病初期在菌盖上出现淡黄色水渍状斑点、斑块，继而很快使菇体变为淡黄色或土黄色水渍状。腐烂并散发出恶臭气味，发病严重的菇棚如同鸡舍般难闻，染病菇体如同煮熟般腐烂，失去食用价值。
2.2发病原因细菌个体极小，在培养料、水及土壤中广泛存在，空气传播和人体带入及害虫类带入，都是发病的重要原因。尤其当培养料发酵不彻底或不均匀，发菌或出菇场所不洁净时均易发生细菌病害。由于细菌在条件适合时如10～30℃，相对空气湿度90%时蔓延速度很快，因此危害很大。当温度过高或过低及湿度过小时，细菌可形成休眠芽孢，这种芽孢可在不利环境条件下长期存在，待条件适合时萌发并继续形成危害。另外，高温环境尤其是冬春季节栽培时菇棚保温条件下，一般伴随着通风不良，这也是使细菌病害能形成区域危害的重要原因。
2.3防治措施①基料发酵要充分、均匀，并于播种前加入0.2%甲醛，充分拌匀后再装袋播种。②培养和菇棚等场所启用前先用多菌灵甲醛溶液喷洒灭杀。③对菇棚周围喷洒600倍DDV杀虫以防虫类带入。④发现菇体有水渍状斑点时，即迅速检查棚内发病情况如染病菇超过20%时，即应全面摘除病菇，并刮除染病区表层1～2cm厚，清理出棚焚烧或水烫处理均匀也可喷洒5%甲醛后深埋处理。⑤发病严重的菇棚，立即加强通风，并停止喷水，摘除病菇及健壮菇，形成无菇期，分别喷洒1次6%甲醛溶液和200单位链霉素或1%漂白粉。
3块菌病
3.1病害症状该菌丝与平菇菌丝相仿，肉眼无法区别，它可深入基料内部与平菇菌丝争夺营养，水分以及生存空间，抑制平菇生长，使其失去出菇能力。其菌丝体生理成熟后，在培养料出菇面形成子囊果，尤其是畦栽时在菌柱周围与土壤接触区域大面积发生；群生或集生的子囊果外形呈脑状皱纹块，极似去掉涩皮的核桃仁，皱皱巴巴不舒服；初出现时大多数菇农误认为是平菇现蕾，结果数天之后仍无分化现象，只是子囊果初期的奶白色转为浅奶黄色，再逐渐为浅黄褐色至褐红色，且其体积也在不断膨大，此时慌忙采取各种手段防治，为时已晚。该病害发生严重时，可使整批栽培料只菇不出。棚内散发高浓度漂白粉的气味，是块菌发生的重要标志之一。
3.2发病原因狄氏囊菌是食用菌栽培生产中的恶性杂菌。孢子大量存在于土壤或基料中，生命力极强，遇16～35℃温度70%以上的空气湿度，可很快萌发并形成危害。该病菌对覆土式栽培的平菇危害特别严重。
3.3防治措施①培养料一定要经充分、均匀的堆酵处理，且含水量不高于63%。②栽培用土的处理参照前述。③菌袋进棚前，除按前述要求处理大棚外，间隔5d重喷1～2次1.2%以上浓度的漂白粉溶液。有发病记录的地区，还要加喷一遍多菌灵、甲醛溶液。④一旦发现块菌发生，大棚内应立即加强通风，降低温度和湿度，并将发病区域及其外沿3cm（深度视发病时间及程度而定）连土带培养料挖除，回填经处理的细土，并全棚地毯式喷洒1次1%漂白粉溶液，发病挖除部位涂抹400倍多菌灵溶液。
4霜霉病
4.1病害症状发病初期在培养料表层形成白色，棉絮状菌丝，并慢慢扩大覆盖面，其菌丝所到之处不出菇，继而侵染正常菇蕾，菇体基部，使菇体变为淡土黄色至黄褐色、变软腐烂，腐烂菇体后期轻微臭味，但较细菌病害侵染的腐烂病菇臭味小得多。染病菇区域及霉菌菌丝覆盖区域不再出菇。
4.2发病原因该霉菌在乎菇生长的温度范围内均可发生并危害，且多发生于深秋至初春栽培季节，即有低温发病趋势。尤其该季节又是大批投料生产的黄金时间段，因此越发感觉该病害的严重性。该霉菌孢子大量寄生于土壤、基料及水中，通过空气，人体及虫也可传播，染病菇体弹射的孢子是加重危害的重要途径之一。
4.3防治措施①栽培用棚，栽培用土的处理，参考“软腐病的防治”。②发现病菇后，即将菇棚加大通风，停止喷水使基料表层干燥，及时摘除病菇并焚烧处理，切忌乱弃后形成新的污染源。③对用过的工具及病菇发生区使用5%甲醛或80倍漂白粉处理。④发病较重的菇棚，在全部采光后相应处理基料表层，刮除表层后重喷多菌灵、甲醛溶液并密闭48h，之后加强通风，不予喷水，约10d后重复出菇管理。⑤食用菌生产专业村（区）一旦发现该病害等，应禁止互相串棚、参观，以免交叉污染。
5僵菇病
5.1病害症状幼菇在分化前染病，很小就死亡，菌盖直径约1cm左右，整个菇体（菇丛）呈干、白、僵化状，不软、不腐、不臭，有的菌盖表皮紧绷、发亮，有的菌盖上似有一层粉状物。培养料未见任何异变，但此后将不再出菇。
5.2发病原因该霉菌大量寄生于土壤菇棚的缝隙及原料中，空气、人体、虫也是重要的传播途径。
5.3防治措施无防治特效药，重点是“防”，适当降低棚内温度加大通风，药防参考“软腐病”。
