果树在盆内每年的生长量较大，如放任生长其结果情况也难以控制。为保持完美，紧凑的树形，有效地控制生长与结果，每年要进行多次修剪。从修剪时期上，可分为休眠期修剪（冬季修剪）和生长期修剪（夏季修剪）。
果树在休眠期和生长期都可以进行修剪，但不同时期修剪有不同的任务。
休眠期修剪即冬季修剪，从秋季正常落叶后到翌年萌芽前进行，此时果树的贮藏养分已由枝叶向枝于和根部运转，并且贮藏起来。这时修剪，对养分的损失较少，而且因为没有叶片，容易分析树体的结构和修剪反应。因此，冬季修剪是多数果树的主要修剪时期；但也有例外，例如核桃树休眠期修剪会引起伤流，必须在秋季落叶前或春季萌芽后到开花前进行修剪；葡萄萌芽前也有伤流期，修剪要躲过这一时期进行。
冬季修剪要完成的果树主要整形修剪任务是培养骨干枝，平衡树势，调整从属关系，培养结果枝组，控制辅养枝，促进部分枝条生长或形成花芽，控制枝量，调节生长枝与结果枝的比例和花芽量，控制树冠大小和疏密程度；改善树冠内膛的光照条件，以及对衰老树进行更新修剪。
生长期修剪分春、夏、秋三季进行。在春季萌芽后到开花前进行的春季修剪，又分为花前复剪和晚剪。花前复剪是冬季修剪任务的复查和补充，主要是进一步调节生长势和花量。例如，苹果的花芽不易识别时，可在冬剪时有意识地多留一些“花芽”，在花芽开绽到开花前进行一次复剪，疏除过多的花芽，回缩冗长的枝组，这样有利于花量控制、提高坐果率和结果枝组的培养。幼树萌芽前后，加大辅养枝的开张角度，同时进行环剥，以提高萌芽率，增加枝量，这样有利于幼树早结果。晚剪是指对萌芽率低、发枝力差的品种萌芽后再短截，剪除已经萌芽的部分。这种“晚剪”措施，有提高萌芽率、增加枝量和减弱顶端优势的作用，是幼树早结果的常用技术。
夏季是果树生长的旺盛时期，也是控制旺长的好时机，许多果树都利用夏季修剪来控制枝势、减少营养消耗，以利树势缓和、花芽形成和提高坐果率，还能改善树冠内部光照条件，提高果实质量。常用的措施有撑枝开角、摘心疏枝、曲枝扭梢。环剥环刻等，是葡萄、桃和苹果幼树不可缺少的技术措施。
秋季落叶前对过旺树进行修剪，可起到控制树势和控制枝条旺长的作用。此时疏除大枝，回缩修剪，对局部的刺激作用较小，常用于一些修剪反应敏感的树种、品种。秋季剪去新梢末成熟或木质化不良的部分，可使果树及早进入休眠期，有利于幼树越冬。生长期修剪损失养分较多，又能减少当年的生长量，修剪不宜过重，以免过分削弱树势。
总之，不同时期的修剪各具有一些特点，生产上应根据具体情况相互配合、综合应用。目前生产上往往只重视冬季修剪而忽视生长期修剪，这是不对的。
