一、什么是“食用菌菌种退化”
“菌种退化”，是食用菌生产者最关心的最大问题。
微生物学上“菌种退化”（菌种衰退）的定义：菌种在培养或保藏过程中，由于自发突变的存在，出现某些原有优良生产性状的劣化、遗传标记的丢失等现象，称为菌种的衰退。“食用菌菌种退化”，是一个非常抽象的，是很难具体用文字定义的现象，我们可以这样认为：在食用菌生产中，因菌种（母种）的遗传性状发生改变，导致产量和质量的下降，这一现象就叫做“食用菌菌种退化”。产量和质量的下降是“食用菌菌种退化”最终结果，避免“食用菌菌种退化”，就要搞清楚引起“食用菌菌种退化”的原因，和“食用菌菌种退化”的表现是什么？
二、“食用菌菌种退化”的原因
1、培养环境
食用菌的生长环境包括：温度、湿度、光照、氧气，其中能够引起“食用菌菌种退化”的环境因素主要是温度，这是因为温度对生物代谢的影响最大，当处于极度不适的温度环境中，菌种的遗传特性发生改变，丧失了应该具有的优良生产性状，母种培养、保藏、运输时，遭受高温、低温（比如零下），都极易引起“食用菌菌种退化”。
2、培养基
培养基不适合菌种生长，会引起“食用菌菌种退化”，包括：培养基的营养构成、pH值、培养基过于丰富、培养基过于贫瘠，或者理解为培养基不适合其生长。关于食用菌母种培养基，现有理论和教科书远远滞后于实际生产，所谓贫瘠与丰富培养基交替等理论，都是套用微生物学的理论和概念，在食用菌工厂化生产中并没有实际的指导意义。
3、转代次数
转代次数过多，从微生物理论基础上分析，转代次数过多是容易出现“食用菌菌种退化”的，但是在实际食用菌生产中，应该是：采用不正确的菌种制作和培养的转代，容易引起“食用菌菌种退化”，转代的次数越多，引起“食用菌菌种退化”的可能性就越大。
4、粉孢子、节孢子和分生孢子
对于在母种菌丝阶段，能够产生粉孢子、节孢子和分生孢子的品种，容易出现“食用菌菌种退化”，粉孢子等在条件合适的时候会萌发出菌丝，这些菌丝是不具有结实能力的，或者说结实能力很差。继续转代后，和正常的菌丝互相混合在一起，整体从菌丝的外观有可能没有任何的表现，但是最后会影响到最终的产量和质量。
5、菌种保藏
食用菌生产离不开菌种保藏，菌种保藏的方法不当，保藏的时间过长，保藏温度过高、过低，都会可能会引起“食用菌菌种退化”，特别是在保藏期间，斜面母种出现子实体，子实体虽然不会长得很大，但是只要有菌盖形成，就可能有孢子弹射到斜面上，条件合适就会萌发出菌丝，形成无性繁殖和有性繁殖混在一起的情况，造成“食用菌菌种退化”。
三、“食用菌菌种退化”的表现是什么
表现在一个品种，或者是一个品系上的“食用菌菌种退化”最严重，食用菌的品种多，具体表现也不相同，如果：菌丝生长缓慢、尖端生长不整齐、长势稀疏、分泌色素变多，总之母种阶段，出现连续的，可以遗传的异常表现，就很有可能是出现菌种退化了。
上面描述的几种“食用菌菌种退化”的表现大多时候并不明显，但是最终产量和质量连续性的下降，而且能够排除出菇环境的影响，就要考虑是“食用菌菌种退化”了，严重时，在原基形成和子实体分化时就有所表现，畸形菇增多也是作为判断“食用菌菌种退化”的依据之一。
“食用菌菌种退化”不是短时间发生的，也不是某一次转代就会突然出现的，因此，菌种退化的表现是悄然无息而来的，这样更容易引起忽视。
四、如何避免食用菌菌种退化
针对上述“食用菌菌种退化”的几点原因，为菌种生长提供合适的生长环境、合适的培养基、尽量降低转代次数、减少粉孢子、减少节孢子、减少分生孢子、做好菌种保藏，就能够尽最大程度的避免“食用菌菌种退化”。
总而言之一句话，按照正规的、严谨的技术要求进行菌种生产制作，是避免“食用菌菌种退化”的根本方法，一旦出现菌种退化，要及时的更换菌种。
